全日制和非全日制研究生毕业证的主要区别在于标注的学习形式不同。
非全日制研究生毕业证书上会明确标注“非全日制”字样，以表明这种研究生教育的学习方式是非脱产的，即学生可以在工作的同时进行学习。而全日制研究生毕业证书则不会标注这样的字样，因为它代表的是学生按照学校规定的时间表进行全日制学习并顺利毕业。
然而，这个标注对于证书本身的影响并不大。无论是全日制还是非全日制的研究生毕业证书，它们都是经过国家教育部门认可的，具有相同的法律效力。这两种毕业证书都可以在学信网上进行查询，并可以作为应聘工作、评定职称、申请落户积分、考公务员、申请读博士、升职加薪等的重要依据。
此外，非全日制研究生在完成学业后，同样可以获得与全日制研究生相同的硕士学位证书。这个学位证书也是经过国家教育部门认可的，与全日制研究生的学位证书具有相同的法律效力。
因此，虽然全日制和非全日制研究生毕业证书在标注的学习形式上有所不同，但它们的认可度和价值是相同的。选择全日制还是非全日制研究生教育，应该根据个人的实际情况和需求来决定。